Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP1-1Q07627 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms