Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4BQ07343 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4BQ07343 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms