Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 RSC1YGR056W 2787 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 GCN1YGL195W 8019 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 GLC3YEL011W 2115 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SLK19YOR195W 2466 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RPS14AYCR031C 414 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YCR108CYCR108C 192 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 FAR7YFR008W 666 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YGR073CYGR073C 372 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SLX9YGR081C 633 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YLR379WYLR379W 375 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 ATX1YNL259C 222 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RBL2YOR265W 321 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 NOP12YOL041C 1380 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 BRE5YNR051C 1548 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 TDA1YMR291W 1761 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 NEL1YHR035W 1893 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 CSR2YPR030W 3366 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 POL4YCR014C 1749 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YDL071CYDL071C 375 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 NCB2YDR397C 441 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RPL1BYGL135W 654 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YGR290WYGR290W 444 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 PCL5YHR071W 690 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 LRP1YHR081W 555 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SDL1YIL167W 633 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 AIM25YJR100C 984 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 LCB5YLR260W 2064 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 VAC14YLR386W 2643 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 IMP1YMR150C 573 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 POL2YNL262W 6669 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YPL107WYPL107W 747 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RPL1AYPL220W 654 nt3.06□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YPS6YIR039C 1614 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YDL187CYDL187C 330 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 CPR5YDR304C 678 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SMT3YDR510W 306 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SYS1YJL004C 612 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RNH203YLR154C 333 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 ATP18YML081C-A 180 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 TAP42YMR028W 1101 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RUF22RUF22 515 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 MPD2YOL088C 834 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YPR077CYPR077C 372 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 MBA1YBR185C 837 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RAD2YGR258C 3096 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 JEN1YKL217W 1851 nt3.05□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 NUP60YAR002W 1620 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SET1YHR119W 3243 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 ERG11YHR007C 1593 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 CDC40YDR364C 1368 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 FIN1YDR130C 876 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 TDA2YER071C 381 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YFR054CYFR054C 579 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YGR039WYGR039W 312 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 MVB12YGR206W 306 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SCEIQ0160 708 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 BET4YJL031C 984 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 LSM1YJL124C 519 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 IME1YJR094C 1083 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 ILM1YJR118C 612 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SWS2YNL081C 432 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YNL089CYNL089C 477 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RFC3YNL290W 1023 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RPS7AYOR096W 573 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 AFT2YPL202C 1251 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YPR177CYPR177C 372 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 MUB1YMR100W 1863 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SSE2YBR169C 2082 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 COP1YDL145C 3606 nt3.04□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SIZ1YDR409W 2715 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 AAD3YCR107W 1092 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YDL242WYDL242W 354 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YDR115WYDR115W 318 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 FMN1YDR236C 657 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YFL019CYFL019C 354 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RPL11BYGR085C 525 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 DLS1YJL065C 504 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 VPS63YLR261C 327 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 HHF1YBR009C 312 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YOR277CYOR277C 309 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 RPL11AYPR102C 525 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SEC66YBR171W 621 nt3.03□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 PEX5YDR244W 1839 nt3.03□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ARG2YJL071W 1725 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 NSA1YGL111W 1392 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 AVT5YBL089W 1380 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 TOP1YOL006C 2310 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPL30YGL030W 318 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YGR228WYGR228W 345 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YIR040CYIR040C 333 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 UBX4YMR067C 1251 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPL13BYMR142C 600 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 PET123YOR158W 957 nt3.02□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 HRD1YOL013C 1656 nt3.01□□□□□ -1.93
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