Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNG1Q06432 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNG1Q06432 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms