Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME1Q06323 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms