Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	SIN3	YOL004W	4611 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	RSE1	YML049C	4086 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	NRG1	YDR043C	696 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	THO1	YER063W	657 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	SDP1	YIL113W	630 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	LTP1	YPR073C	486 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	MSH2	YOL090W	2895 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	PEX6	YNL329C	3093 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YBR259W	YBR259W	2067 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	CHS3	YBR023C	3498 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	MDV1	YJL112W	2145 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	MRPL9	YGR220C	810 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	AIM25	YJR100C	984 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	SEC14	YMR079W	915 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	BUD21	YOR078W	645 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	TUM1	YOR251C	915 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	POL4	YCR014C	1749 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	URK1	YNR012W	1506 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	MYO5	YMR109W	3660 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	VPS38	YLR360W	1320 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	MAK5	YBR142W	2322 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YFL012W	YFL012W	447 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	PEF1	YGR058W	1008 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	GOS1	YHL031C	672 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YLR050C	YLR050C	486 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YLR217W	YLR217W	324 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	HHF2	YNL030W	312 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	RPL33A	YPL143W	324 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	ATP20	YPR020W	348 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	UBP8	YMR223W	1416 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	HFM1	YGL251C	3564 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	SNQ2	YDR011W	4506 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YNL011C	YNL011C	1335 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	STE2	YFL026W	1296 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	ATG27	YJL178C	816 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YLR297W	YLR297W	390 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YML037C	YML037C	1023 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	RSM19	YNR037C	276 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	GCY1	YOR120W	939 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	SME1	YOR159C	285 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	snR35	snR35	204 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	BPT1	YLL015W	4680 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YDR250C	YDR250C	276 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YDR381C-A	YDR381C-A	345 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	VMA8	YEL051W	771 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	RMD6	YEL072W	696 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YGR115C	YGR115C	780 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	VMA10	YHR039C-A	345 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	LIP2	YLR239C	987 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YOL107W	YOL107W	1029 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	YCG1	YDR325W	3108 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	DUF1	YOL087C	3351 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	GYL1	YMR192W	2163 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	AVT5	YBL089W	1380 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	ARP5	YNL059C	2268 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	FRE2	YKL220C	2136 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	VAC14	YLR386W	2643 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	PEX5	YDR244W	1839 nt		3.21	□□□□□ -1.89
MRD1	Q06106	CDC37	YDR168W	1521 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	RTT105	YER104W	627 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	EST3	YIL009C-A	546 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YNL303W	YNL303W	348 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	PFY1	YOR122C	381 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	PEX27	YOR193W	1131 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YOR387C	YOR387C	621 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YLR278C	YLR278C	4026 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	VPS64	YDR200C	1815 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	RSN1	YMR266W	2862 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	NOP56	YLR197W	1515 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	SLU7	YDR088C	1149 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	VAB2	YEL005C	849 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YFL015C	YFL015C	495 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YHR212C	YHR212C	336 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YIL141W	YIL141W	390 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YKR011C	YKR011C	1062 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YAR060C	YAR060C	336 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YLR230W	YLR230W	306 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	SUB1	YMR039C	879 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YPL107W	YPL107W	747 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	SRC1	YML034W	2505 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	MNT3	YIL014W	1893 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	UBP14	YBR058C	2346 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	VAS1	YGR094W	3315 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YKL069W	YKL069W	543 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	RRG7	YOR305W	729 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	snR24	snR24	89 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	MUB1	YMR100W	1863 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	VPS3	YDR495C	3036 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	GPM2	YDL021W	936 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	SLD5	YDR489W	885 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	TPK3	YKL166C	1197 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	SSN8	YNL025C	972 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	MPD2	YOL088C	834 nt		3.18	□□□□□ -1.9
MRD1	Q06106	YPL276W	YPL276W	438 nt		3.18	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms