Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 YKE2YLR200W 345 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 NNT1YLR285W 786 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 NGL1YOL042W 1092 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 SLK19YOR195W 2466 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 OAF3YKR064W 2592 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 TGL3YMR313C 1929 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 RDS1YCR106W 2499 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 PSP1YDR505C 2526 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 SPT2YER161C 1002 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YHR125WYHR125W 306 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 EMC2YJR088C 879 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 AIM29YKR074W 468 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 TIF11YMR260C 462 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 CHD1YER164W 4407 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 ADY4YLR227C 1482 nt4.22□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 MRPL11YDL202W 750 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YDR262WYDR262W 819 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 SPO73YER046W 432 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 MTM1YGR257C 1101 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 MCR1YKL150W 909 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 DAD2YKR083C 402 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YLR101CYLR101C 396 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YML108WYML108W 318 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 ARG80YMR042W 534 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RIM9YMR063W 720 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RIO2YNL207W 1278 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 SIL1YOL031C 1266 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YOR331CYOR331C 558 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YPR197CYPR197C 564 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 DPB3YBR278W 606 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 ABP140YOR239W 1887 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 HAA1YPR008W 2085 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 DAP2YHR028C 2457 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 SIN4YNL236W 2925 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 MDM36YPR083W 1740 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 TAF12YDR145W 1620 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 CIT1YNR001C 1440 nt4.21□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 SHE4YOR035C 2370 nt4.2□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 snR59snR59 78 nt4.2□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 OTU1YFL044C 906 nt4.2□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 BIG1YHR101C 1008 nt4.2□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 ENT3YJR125C 1227 nt4.2□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RPS16AYMR143W 432 nt4.2□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YOR053WYOR053W 342 nt4.2□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YOL019WYOL019W 1656 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 PAM1YDR251W 2493 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 GIP4YAL031C 2283 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 PES4YFR023W 1836 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YER077CYER077C 2067 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 CPR5YDR304C 678 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YER135CYER135C 393 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 TDA8YAL064C-A 381 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 INO4YOL108C 456 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YPL185WYPL185W 396 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 DAL5YJR152W 1632 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 TRK1YJL129C 3708 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YGR117CYGR117C 1431 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 OPT2YPR194C 2634 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 UTP25YIL091C 2166 nt4.19□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 ASI1YMR119W 1875 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RSC3YDR303C 2658 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YER068C-AYER068C-A 432 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 FLD1YLR404W 858 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RPC40YPR110C 1008 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YPR136CYPR136C 513 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 OM14YBR230C 405 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RAD26YJR035W 3258 nt4.18□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 VPS9YML097C 1356 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RRN6YBL014C 2685 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 SWF1YDR126W 1011 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YDR537CYDR537C 606 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RTT102YGR275W 474 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 PCL5YHR071W 690 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RIM11YMR139W 1113 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YPR096CYPR096C 303 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 MSS18YPR134W 807 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YBR285WYBR285W 435 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 NCS2YNL119W 1482 nt4.17□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 PEP7YDR323C 1548 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 SSL1YLR005W 1386 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 CDC55YGL190C 1581 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 ALO1YML086C 1581 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YDR526CYDR526C 471 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YGR017WYGR017W 894 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 HUB1YNR032C-A 222 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 YOR392WYOR392W 444 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 MTR4YJL050W 3222 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 SHS1YDL225W 1656 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 UBP6YFR010W 1500 nt4.16□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 RRI2YOL117W 1938 nt4.15□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 MSD1YPL104W 1977 nt4.15□□□□□ -1.74
HRQ1Q05549 BMH2YDR099W 822 nt4.15□□□□□ -1.75
HRQ1Q05549 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.15□□□□□ -1.75
HRQ1Q05549 AGE2YIL044C 897 nt4.15□□□□□ -1.75
HRQ1Q05549 RPA12YJR063W 378 nt4.15□□□□□ -1.75
HRQ1Q05549 RPL40BYKR094C 387 nt4.15□□□□□ -1.75
HRQ1Q05549 PDP3YLR455W 915 nt4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.6 ms