Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms