Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YMR046CYMR046C 1323 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 HTB1YDR224C 396 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 MAM1YER106W 909 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YHR212CYHR212C 336 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YAR060CYAR060C 336 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 FAR3YMR052W 615 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YNL013CYNL013C 378 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 PDR17YNL264C 1053 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 DIM1YPL266W 957 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RFC5YBR087W 1065 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 SPO71YDR104C 3738 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YBR259WYBR259W 2067 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 MUB1YMR100W 1863 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YDR061WYDR061W 1620 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 PEA2YER149C 1263 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RPC25YKL144C 639 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RPL17AYKL180W 555 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 SUB1YMR039C 879 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 EXO84YBR102C 2262 nt3.3□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 POL2YNL262W 6669 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 VAC14YLR386W 2643 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 SAG1YJR004C 1953 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 CWH41YGL027C 2502 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 URB2YJR041C 3525 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 COX6YHR051W 447 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 CTK2YJL006C 972 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RPS21BYJL136C 264 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 MER1YNL210W 813 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 STI1YOR027W 1770 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 PMR1YGL167C 2853 nt3.29□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 DIA2YOR080W 2199 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 TIF4631YGR162W 2859 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 TCP1YDR212W 1680 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 ATC1YDR184C 885 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 PRE4YFR050C 801 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 VMA10YHR039C-A 345 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YJL032WYJL032W 315 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 ATG27YJL178C 816 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YKL070WYKL070W 510 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 snR35snR35 204 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 SRP1YNL189W 1629 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 NOP56YLR197W 1515 nt3.28□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YGL176CYGL176C 1665 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YPL150WYPL150W 2706 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 NEW1YPL226W 3591 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YGR283CYGR283C 1026 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YAP5YIR018W 738 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 RNR2YJL026W 1200 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 CCW14YLR390W-A 717 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YSP2YDR326C 4317 nt3.27□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 STP2YHR006W 1626 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 KHA1YJL094C 2622 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 MAK21YDR060W 3078 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 TSC11YER093C 4293 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 PSK1YAL017W 4071 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 ATP16YDL004W 483 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 CPR5YDR304C 678 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YJL169WYJL169W 369 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 GPX1YKL026C 504 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YKL115CYKL115C 393 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YBL065WYBL065W 345 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 SWD3YBR175W 948 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.26□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 DOA4YDR069C 2781 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 MED1YPR070W 1701 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 UTP5YDR398W 1932 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 EMI1YDR512C 564 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YGL039WYGL039W 1047 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 GOS1YHL031C 672 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YIL141WYIL141W 390 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 SMD2YLR275W 333 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 RPL23AYBL087C 414 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 MPD2YOL088C 834 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YOL107WYOL107W 1029 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YBR090CYBR090C 369 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 CST9YLR394W 1449 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 DUF1YOL087C 3351 nt3.25□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 RIX1YHR197W 2292 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 STT4YLR305C 5703 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YDR186CYDR186C 2634 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 ATP22YDR350C 2055 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 VPS33YLR396C 2076 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YFL015CYFL015C 495 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 VEL1YGL258W 621 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 LST7YGR057C 729 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 GTR2YGR163W 1026 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 LSM8YJR022W 330 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 ARL1YBR164C 552 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 ROM1YGR070W 3468 nt3.24□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 NGG1YDR176W 2109 nt3.23□□□□□ -1.89
SYF1Q04048 SKO1YNL167C 1944 nt3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.5 ms