Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms