Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms