Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 RIX1YHR197W 2292 nt2.9□□□□□ -1.94
SKO1Q02100 RIM13YMR154C 2184 nt2.9□□□□□ -1.94
SKO1Q02100 GCN1YGL195W 8019 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDR262WYDR262W 819 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YGL082WYGL082W 1146 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YGL109WYGL109W 324 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YLL044WYLL044W 447 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ILV5YLR355C 1188 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YNL043CYNL043C 321 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 AGE1YDR524C 1449 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 BMS1YPL217C 3552 nt2.9□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 TOM1YDR457W 9807 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YNR063WYNR063W 1824 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDL158CYDL158C 309 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ANR2YKL047W 1551 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 MCR1YKL150W 909 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 VMA6YLR447C 1038 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RPL23AYBL087C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 CSI2YOL007C 1026 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 NTC20YBR188C 423 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YKL100CYKL100C 1764 nt2.89□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 EPL1YFL024C 2499 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ATP22YDR350C 2055 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDR193WYDR193W 399 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RSM28YDR494W 1086 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 PGD1YGL025C 1194 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 USE1YGL098W 738 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 TAD1YGL243W 1203 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 QCR10YHR001W-A 234 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 CDC123YLR215C 1083 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 CUR1YPR158W 759 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 VHR2YER064C 1518 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SHQ1YIL104C 1524 nt2.88□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 CIN8YEL061C 3003 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 LST4YKL176C 2487 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YCL019WYCL019W 5313 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SPO71YDR104C 3738 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 NUP60YAR002W 1620 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 OPI6YDL096C 327 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RMT2YDR465C 1239 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YEA4YEL004W 1029 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 THG1YGR024C 714 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RPL11BYGR085C 525 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 DAD2YKR083C 402 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RPL11AYPR102C 525 nt2.87□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 DOA4YDR069C 2781 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 PDC2YDR081C 2778 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YAT2YER024W 2772 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 DBF20YPR111W 1695 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ARP4YJL081C 1470 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YCR013CYCR013C 648 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDR248CYDR248C 582 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDR442WYDR442W 393 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 PAU10YDR542W 363 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RPL30YGL030W 318 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SAE2YGL175C 1038 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 PAU11YGL261C 363 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YGR160WYGR160W 612 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 PCL5YHR071W 690 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 EST3YIL009C-A 546 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 NBP1YLR457C 960 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 PAU4YLR461W 363 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RPL20BYOR312C 519 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 MBA1YBR185C 837 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ERT1YBR239C 1590 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YDL180WYDL180W 1644 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 STU2YLR045C 2667 nt2.86□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YNL193WYNL193W 1677 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RCY1YJL204C 2523 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 JJJ2YJL162C 1752 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 EXO5YBR163W 1758 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YSP2YDR326C 4317 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SNA4YDL123W 423 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YGR017WYGR017W 894 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 MST28YAR033W 705 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YLR257WYLR257W 966 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 PAI3YMR174C 207 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RPL16BYNL069C 597 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SUS1YBR111W-A 291 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 CBP6YBR120C 489 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ADF1YCL058W-A 342 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 FUN30YAL019W 3396 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SSM4YIL030C 3960 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YCK2YNL154C 1641 nt2.85□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SRB4YER022W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 NET1YJL076W 3570 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ARK1YNL020C 1917 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.84□□□□□ -1.95
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