Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPIBQ01892 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPIBQ01892 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms