Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRB1P82279 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CRB1P82279 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRB1P82279 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRB1P82279 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRB1P82279 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRB1P82279 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRB1P82279 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRB1P82279 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRB1P82279 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRB1P82279 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CRB1P82279 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRB1P82279 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRB1P82279 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRB1P82279 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRB1P82279 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRB1P82279 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRB1P82279 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRB1P82279 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms