Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNB1P62873 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNB1P62873 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNB1P62873 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms