Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL23P62829 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL23P62829 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL23P62829 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL23P62829 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL23P62829 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL23P62829 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms