Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms