Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY3P57055 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY3P57055 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms