Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE1P56817 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE1P56817 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE1P56817 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE1P56817 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE1P56817 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms