Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEMP55040 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEMP55040 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEMP55040 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GEMP55040 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEMP55040 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEMP55040 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEMP55040 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEMP55040 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEMP55040 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEMP55040 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GEMP55040 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GEMP55040 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms