Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RARSP54136 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARSP54136 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARSP54136 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RARSP54136 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARSP54136 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARSP54136 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARSP54136 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARSP54136 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARSP54136 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARSP54136 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARSP54136 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms