Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms