Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN6P51797 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN6P51797 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms