Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPT1P50897 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPT1P50897 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPT1P50897 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPT1P50897 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPT1P50897 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms