Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATMP50440 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATMP50440 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATMP50440 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATMP50440 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATMP50440 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms