Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF6P49848 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF6P49848 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF6P49848 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF6P49848 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms