Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK8P49336 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK8P49336 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK8P49336 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK8P49336 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK8P49336 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK8P49336 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK8P49336 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK8P49336 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms