Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms