Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC4P43686 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms