Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCAMP43121 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCAMP43121 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCAMP43121 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCAMP43121 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCAMP43121 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCAMP43121 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCAMP43121 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCAMP43121 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCAMP43121 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCAMP43121 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms