Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYH11P35749 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYH11P35749 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYH11P35749 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYH11P35749 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYH11P35749 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms