Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT9P35527 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT9P35527 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms