Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFC1P35251 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFC1P35251 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFC1P35251 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms