Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXP28300 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXP28300 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXP28300 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LOXP28300 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXP28300 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms