Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNCP24863 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNCP24863 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNCP24863 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNCP24863 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNCP24863 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNCP24863 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNCP24863 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNCP24863 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNCP24863 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNCP24863 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNCP24863 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNCP24863 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNCP24863 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNCP24863 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNCP24863 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCNCP24863 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNCP24863 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNCP24863 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNCP24863 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms