Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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