Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ME2P23368 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME2P23368 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME2P23368 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME2P23368 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME2P23368 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms