Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDSP20132 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSP20132 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSP20132 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSP20132 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDSP20132 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDSP20132 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSP20132 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDSP20132 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSP20132 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms