Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms