Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms