Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB3P14651 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms