Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFTRP13569 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFTRP13569 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFTRP13569 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFTRP13569 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFTRP13569 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFTRP13569 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFTRP13569 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFTRP13569 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CFTRP13569 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFTRP13569 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFTRP13569 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFTRP13569 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
CFTRP13569 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFTRP13569 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFTRP13569 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CFTRP13569 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFTRP13569 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFTRP13569 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFTRP13569 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFTRP13569 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFTRP13569 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CFTRP13569 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CFTRP13569 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CFTRP13569 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFTRP13569 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFTRP13569 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFTRP13569 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFTRP13569 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFTRP13569 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFTRP13569 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms