Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT3P12035 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT3P12035 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms