Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms