Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P0DMU3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P0DMU3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P0DMU3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P0DMU3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P0DMU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms