Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYBBP04839 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYBBP04839 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYBBP04839 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYBBP04839 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYBBP04839 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYBBP04839 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYBBP04839 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYBBP04839 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYBBP04839 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms