Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms