Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP2O95045 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP2O95045 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP2O95045 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP2O95045 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP2O95045 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP2O95045 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP2O95045 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP2O95045 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP2O95045 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP2O95045 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP2O95045 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms