Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms