Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms